Η ανατομία και η φυσιολογία των φυτών αποτελούν δύο αλληλένδετους κλάδους της βοτανικής που μελετούν τη δομή και τη λειτουργία των φυτικών οργανισμών. Η ανατομία εξετάζει την εσωτερική οργάνωση των φυτών, τα κύτταρα, τους ιστούς και τα όργανα, ενώ η φυσιολογία εστιάζει στις βιοχημικές και φυσικές διεργασίες που συμβαίνουν μέσα στα φυτά και επιτρέπουν την επιβίωσή τους.
Η κατανόηση της ανατομίας των φυτών είναι απαραίτητη για την ερμηνεία των φυσιολογικών λειτουργιών. Για παράδειγμα, η δομή των φύλλων, με τα στομάτια και το μεσοφύλλωμα, καθορίζει την αποτελεσματικότητα της φωτοσύνθεσης. Ομοίως, η δομή των ριζών, με τις τριχοειδείς απορροφητικές ρίζες, επηρεάζει την ικανότητα του φυτού να απορροφά νερό και θρεπτικά συστατικά από το έδαφος.
Η φυσιολογία των φυτών περιλαμβάνει τη μελέτη της φωτοσύνθεσης, της αναπνοής, της μεταφοράς νερού και θρεπτικών συστατικών, της ανάπτυξης και της αναπαραγωγής. Οι φυτικές ορμόνες, όπως οι αυξίνες, οι κυτοκινίνες και η αβσισσίνη, παίζουν καθοριστικό ρόλο στη ρύθμιση αυτών των διεργασιών. Η μελέτη της φυσιολογίας των φυτών έχει σημαντικές εφαρμογές στη γεωργία, την κηπουρική και τη βιοτεχνολογία.
Στην ιαπωνική γλώσσα, η φράση '植物の解剖学と生理学' (Shokubutsu no Kaihougaku to Seirigaku) μεταφράζεται ακριβώς ως 'Ανατομία και Φυσιολογία Φυτών'. Η ιαπωνική βοτανική έχει μακρά παράδοση και έχει συνεισφέρει σημαντικά στην κατανόηση της φυτικής ζωής.